plugins/base2/uk.ac.ebi.tab2mage/trunk/Tab2MageImporter/tab2mage- affymetrix.txt

Code
Comments
Other
Rev Date Author Line
379 08 Aug 07 dominic 1 # This file contains an experiment exported in tab2mage specification from BASE    
379 08 Aug 07 dominic 2
379 08 Aug 07 dominic 3 Experiment section     
379 08 Aug 07 dominic 4 domain  papa.windows.ebi.ac.uk  
379 08 Aug 07 dominic 5 accession  E-BASE-  E-BASE-1
379 08 Aug 07 dominic 6 quality_control    
451 30 Oct 07 dominic 7 experiment_design_type  BiomolecularAnnotation
451 30 Oct 07 dominic 8 name  Experiment1
451 30 Oct 07 dominic 9 description  test
451 30 Oct 07 dominic 10 release_date  00:00.0
451 30 Oct 07 dominic 11 submission_date  03/05/2007
451 30 Oct 07 dominic 12 submitter  Root
379 08 Aug 07 dominic 13 submitter_email    
379 08 Aug 07 dominic 14 organization    
379 08 Aug 07 dominic 15 publication_title    
451 30 Oct 07 dominic 16 authors  "PRS,DO"
451 30 Oct 07 dominic 17 journal  EMBL journal
451 30 Oct 07 dominic 18 volume    
451 30 Oct 07 dominic 19 issue    
451 30 Oct 07 dominic 20 pages    
451 30 Oct 07 dominic 21 year  2006
451 30 Oct 07 dominic 22 pubmed_id    
379 08 Aug 07 dominic 23
379 08 Aug 07 dominic 24 Protocol section         
379 08 Aug 07 dominic 25 accession  text  name  type  parameters
379 08 Aug 07 dominic 26 P-BASE-6    Affymetrix:Scan  Scanning  resolution (um)
379 08 Aug 07 dominic 27 P-BASE-3    Affymetrix:Hybridization  Hybridization  
379 08 Aug 07 dominic 28 P-BASE-5    Affymetrix:Labelling  Labeling  labelling
379 08 Aug 07 dominic 29 P-BASE-1    Affymetrix:Extraction  Extraction  Diet Availability
379 08 Aug 07 dominic 30 P-BASE-2    Affymetrix:Sample:Processing  Treatment  Diet Provider;Acclimatization Duration
379 08 Aug 07 dominic 31
379 08 Aug 07 dominic 32 Hybridization section         
379 08 Aug 07 dominic 33 File[raw]  File[cdf]  Array[accession]  Array[serial]  Hybridization  LabeledExtract  Dye  Extract  Sample  BioSource  BioMaterialCharacteristics[DevelopmentalStage]  BioMaterialCharacteristics[DiseaseState]  BioMaterialCharacteristics[Species]  BioMaterialCharacteristics[OrganismPart]  BioMaterialCharacteristics[StrainOrLine]  BioMaterialCharacteristics[Cell Type]  Protocol[scanning]  Protocol[hybridization]  Protocol[labeling]  Protocol[extraction]  Protocol[treatment]  Parameter[Diet Provider]  Parameter[Acclimatization Duration]  Parameter[labelling]  Parameter[Diet Availability]  FactorValue[Cell Type]  FactorValue[OrganismPart]  FactorValue[Species]
379 08 Aug 07 dominic 34 jos1761.CEL  MG_U74Av2.CDF  MG_U74v2  Affy-Batch#1.1  hyb1  biosource1.s1.e1.lbe1  Biotin  biosource1.s1.e1  biosource1.s1  biosource1  adult  normal  Mus musculus  abdomen  Buffalo  barrier epithelial cell  P-BASE-6  P-BASE-3  P-BASE-5  P-BASE-1  P-BASE-2  Purina Mills  2 day  massive        apoptosis fated cell
379 08 Aug 07 dominic 35 jos1762.CEL  MG_U74Av2.CDF  MG_U74v2  Affy-Batch#1.2  hyb2  biosource2.s1.e1.lbe1  Biotin  biosource2.s1.e1  biosource2.s1  biosource2  adult  normal  Mus musculus  abdomen  S  B cell  P-BASE-6  P-BASE-3  P-BASE-5  P-BASE-1  P-BASE-2  Dyets    Small  ad libitum      
379 08 Aug 07 dominic 36 jos1763.CEL  MG_U74Av2.CDF  MG_U74v2  Affy-Batch#1.3  hyb3  biosource3.s1.e1.lbe1  Biotin  biosource3.s1.e1  biosource3.s1  biosource3  adult  disease  Mus musculus  abdomen  S  B cell  P-BASE-6  P-BASE-3  P-BASE-5  P-BASE-1  P-BASE-2  Bio-Serv  2 days  Small  restricted    abdomen  
379 08 Aug 07 dominic 37 jos1764.CEL  MG_U74Av2.CDF  MG_U74v2  Affy-Batch#1.4  hyb4  biosource4.s1.e1.lbe1  Biotin  biosource4.s1.e1  biosource4.s1  biosource4  adult  disease  Mus musculus  abdomen  S  B cell  P-BASE-6  P-BASE-3  P-BASE-5  P-BASE-1  P-BASE-2    5 days      Mus musculus  abdomen  B cell

Generated on Tue Nov 21 03:45:11 2023 (UTC) by svndigest 0.11.2pre (dev build 1672)